Bei vorübergehendem Bedarf von landwirtschaftlich genutzten Flächen beauftragt die ÖBB-Infrastruktur AG die Untersuchung und Dokumentation der Böden. Nach Abschluss der Arbeiten ist so die Wiederherstellung der ursprünglichen Bodenqualität möglich. Für den Umgang mit Boden wurde eigens ein Bodenmaßnahmenkatalog verfasst, der die Behandlung des Untergrundes im Zuge der Bauabwicklung festschreibt und die Rekultivierung regelt. Die Überwachung der Vorgaben findet durch eine unabhängige, landwirtschaftliche Bauaufsicht statt. Etwaige Veränderungen beurteilen die Gutachter der zuständigen Landwirtschaftskammer.